多くの戦闘では、操作するメインの刀剣男士と共にバディの刀剣男士も戦う。バディ連撃、双刀連携といった協力技を発動することが可能。 また、戦闘を重ねて絆を深めることでバディ反撃、バディ追撃といったサポート技が発動するようになる。
双刀連携ゲージが最大の時に刀剣男士二振りによる連携アクション「双刀連携」を発動することが可能。 双刀連携発動中はゲージが徐々に減っていくが、その間無敵となり、アクションも変化する。
双刀連携を発動後にゲージが0になるか必殺技を発動することで、刀剣男士二振りが協力して発動する強力な必殺技「双刀必殺」が発動する。